概况　2018年，温州市有泰顺乌岩岭、平阳南麂列岛、泰顺氡泉和瑞安大洋坑4个不同等级自然保护区，总面积412.66平方千米。前二者是国家级自然保护区，后二者是省级自然保护区。

乌岩岭国家级自然保护区　位于泰顺县西北部，总面积18861.5公顷，主要保护对象为中国特产珍禽、国家一级保护动物黄腹角雉及典型的中亚热带森林生态系统。区内有高等植物2503种，占浙江省植物种类的50%以上，其中有列为国家一、二级重点保护的南方红豆杉、伯乐树、香果树等24种，浙江雪胆、泰顺杜鹃等6个植物新种和33个浙江新分布种。脊椎动物342种，占浙江省种类的53%，其中属于国家一级保护动物的有黄腹角雉、白颈长尾雉、云豹、金钱豹、黑麂、金斑喙凤蝶等8种。另有昆虫2133种。乌岩岭自然保护区黄腹角雉种群数量有500余只，是已知的野生黄腹角雉最高种群密度区。被中国动物学会鸟类学分会评为“中国濒危雉类研究基地”。2018年，保护区接待“智慧游学”和集体活动访客80余场次，开展专题活动5起，公众参与人数3万余人。全年接待游客3万余人次，门票收入80余万元。

南麂列岛国家级海洋自然保护区　位于平阳县东南海域，总面积20106公顷，海域面积19071公顷。南麂列岛为基岩丘陵岛屿，由23个海岛、14个暗礁、55个明礁组成，最大岛屿为南麂岛，面积7平方千米；最高峰为大山，海拔229米，总面积20106公顷。该保护区地处温带和热带的过渡带，属于亚热带海洋季风气候区，受台湾暖流和浙江沿岸流影响，贝藻类丰富，具有温带和热带两种区系和地域上断裂分布现象，是中国海域的重要贝藻类基因库。保护区内有海洋贝类403种，约占全国贝类总数的20%；海洋藻类174种，约占全国藻类总数的20%。除海洋贝类、藻类资源外，还有鱼类368种、虾蟹类生物180种。有陆源种子植物317种、脊椎动物55种。全区按功能分为核心区、缓冲区、开发区。保护区内众多的小岛各具特色，大擂岛和竹岛生长大量的水仙花，俗称“水仙花岛”；此外，还有蛇岛、鸟岛等。南麂岛的三盘尾怪石众多，岩壁耸秀，草坪如茵，旅游资源丰富。2018年10月24日，成立南麂列岛国家海洋自然保护区院士工作站。全年接待游客13.14万人次，门票收入808.58万元，旅游总收入1.58亿元。